本发明实施例公开了一种海洋重磁测线拼接方法、装置、电子设备及存储介质。该方法包括：确定第一待拼接测线以及第二待拼接测线；依据第一待拼接测线以及第二待拼接测线各顶点间的距离，确定基准线以及拼接线；确定基准线与拼接线间的重叠观测点范围以及至少两个重复配对点，并依据所述重叠观测点范围以及至少两个重复配对点确定基准线与拼接线重叠部分的系统差；依据所述至少两个重复配对点对拼接线进行重叠测线删除，并依据系统差对重叠测线删除后的拼接线进行数据调整，并将数据调整后的拼接线与基准线进行拼接。采用本方案，实现了测线数据的无缝连接和一体化处理，提高测线拼接的精度，以及测线数据的整体质量和准确性。