本发明涉及乏燃料水池冷却自动控制方法、系统、存储介质和电子设备，包括：获取乏燃料水池的液位信息、温度信息、RRI系统的温度信息和流量信息；根据液位信息和温度信息计算乏燃料水池的负荷趋势值；根据RRI系统的温度信息和流量信息计算RRI系统的负荷裕量；根据负荷趋势值和负荷裕量计算PTR系统当前运行列的目标流量；根据目标流量进行判断，并在当前运行列不可用时触发切换逻辑以切换运行列，以及在可用时调节当前运行列对应的RRI系统的流量。本发明根据乏燃料水池与设备冷却水系统状态参数，控制乏燃料水池冷却，可以在机组正常与事故情况下，更加合理、高效地控制乏池冷却和分配机组冷源，达到缓解和控制机组瞬态或事故的目的。