本发明涉及食品、保健食品、药品技术领域，具体为一种调节脂肪代谢的组合物及其应用。所述组合物包括改性β‑环糊精‑绿原酸包合物、咖啡因、维生素，其中改性β‑环糊精‑绿原酸包合物中的绿原酸、咖啡因是从咖啡豆中提取得到的。所述改性β‑环糊精‑绿原酸包合物是通过将羧甲基‑β‑环糊精经酰氯化处理后，再与三甲胺接枝反应得到改性β‑环糊精；最后将其对绿原酸进行包合得到。本发明中通过绿原酸、咖啡因协同可以更好的起到调节脂肪代谢的作用，具体为：可以改善高血糖、减少脂肪堆积、促进脂肪消耗，且本发明经维生素调配，具有较低的副作用，安全性高。