本申请公开了一种光纤荧光传感器及微环境标志物在体连续监测系统，涉及生物医学光传感领域，该光纤荧光传感器，所述光纤荧光传感器包括：光纤和混合溶液；所述混合溶液涂覆在所述光纤的前端；所述混合溶液包括荧光指示剂、抗漂白剂和凝胶材料。本申请可以以微创内窥介入的方式导入体内并直达指定位置，实现深层组织微环境标志物的感测，从而克服常规荧光成像技术组织穿透深度不足、耗时长，以及长期代谢毒性的问题，并且具有成本低、电绝缘、易操作、响应快速等优点。