本发明提供一种碳捕集装置烟气洗涤系统自动运行控制方法、装置及设备，属于烟气洗涤领域，所述方法包括：基于烟气风机的工作状态，判断烟气洗涤系统是否能够投入烟气洗涤工序；若是，则控制烟气洗涤系统自动开启，并基于烟气洗涤系统在运行过程中的实时检测结果，自动调节烟气洗涤系统内关键设备的运行参数，关键设备为水洗塔液位调节阀、水洗泵、碱液罐补液关断阀、碱液泵和水洗水温度调节阀中的至少一者；若否，则控制烟气洗涤系统自动停运。通过本发明提供的方法，能够在装置运行过程中对烟气洗涤系统内的关键参数加以自动调节，以克服烟气边界条件不断变化的参数并完成烟气的清洁及深度脱硫。