本发明提供一种用于差动保护的数据通信方法及系统，属于电力通信技术领域，具体包括：利用匹配电力用户的类型、历史用电数据确定匹配输电线路的相似输电线路以及线路相似度，根据相似输电线路的历史动作数据、线路相似度确定差动保护装置的动作概率满足要求时，将历史中存在保护动作的接入保护线路作为动作保护线路，利用动作保护线路的历史动作数据、对应的通信线路确定通信网络的运行可靠性满足要求时，将动作概率、通信网络的传输繁忙程度以及运行可靠性作为目标评估数据，基于差动保护装置的目标评估数据进行差动保护装置的光纤接入方式的确定，从而实现了光纤接入的成本和可靠性的均衡控制。