本发明公开了一种故障下配电网交直流变流器限流控制方法及系统包括：搭建虚拟同步发电机变流器并网模型，建立虚拟同步发电机主电路在dq两相旋转坐标系下的数学模型方程，同时建立虚拟同步发电机功率环的控制方程，控制方程包括有功‑频率控制方程和无功‑电压控制方程；判断虚拟同步发电机输出电流有效值是否大于第一预设值，若是，则投入虚拟阻抗控制方式，并判断虚拟同步发电机输出电压有效值是否大于第二预设值，若否，则启动故障无功功率控制与故障有功功率控制。本发明在电网故障时，改变变流器有功功率参考值，根据虚拟同步发电机的功角特性等效减小功角加速面积，提高系统稳定性。