本发明提供一种船舶自动系泊控制方法及系统，属于港口船舶系泊领域，获取船舶靠泊处的气象和水文信息；根据船舶靠泊处水域的气象和水文信息计算出船舶环境载荷；执行船舶系泊作业，实时监测船舶与岸壁距离以及船舶姿态；根据船舶环境载荷对靠泊船舶吸附力进行实时调整；将计算的船舶环境载荷与预设的系统正常工作时船舶吸附力最大值进行比对，如计算的船舶环境载荷超出最大值，则进行报警提示。本发明能够依据实时的船舶载荷调整系泊力，可以节约能耗同时改善船舶的泊稳条件。本发明具有安全预警功能，确保系统在出现故障时，及时报警，保证系泊安全。