本申请提供一种数字控制的电源变换系统，包括：电源变换模块，包括三个单元，三个单元分别包括滤波电容和一个第一开关管，三个单元分别为输入单元、输出单元和调节单元；输入单元包括第一端口，调节单元包括第二端口，输出单元包括第三端口；控制模块，控制模块配置用于采集第一端口的实际电压、第二端口和第三端口的实际电压和期望电压，判断第一端口的实际电压与第二端口和第三端口的期望电压三者中的最小值，将最小值对应单元的第一开关管的占空比调整为设定最大占空比，对其他两个单元的第一开关管进行PID控制，以使第二端口和第三端口对应的实际电压分别等于对应的期望电压。本申请提供的电源变换系统能实现对输出端口的电压进行调节。