本发明公开了一种提升水库变幅区生物多样性和综合效益的系统及建造方法，系统包括岸边储能仓库，水库河道、水库库底岸线和水库水面，沿水库库底岸线设置有固定平台、坐底式浮岛平台和不坐底式浮岛平台；其中，不坐底式浮岛平台布置在水库深水区，坐底式浮岛平台布置在水库水位变幅区。本发明系统的平台通过铅直自动控制模块保障装置在水位变幅大的水库时刻保持相对稳定状态。本发明通过在平台上安装光伏板、移栽植物、安装鸟类栖息所等手段，一方面既可以发电部分解决施工现场用电问题，另一方面也通过原地移栽的方式为水库淹没区的植物提供生存空间，维持、甚至提高当地生态多样性，充分发挥了水库的综合效益。