一种可主动换种、自动卸种的气吸式水稻小区育种单粒精量排种器，包括存储和自主更换种子的主动换种机构、单粒播种的精量排种机构、可自主清理和存储剩余种子的自动卸种机构；换种机构具有可开合的落种口，排种机构具有进种口、排种口、可单粒精量吸附稻种的吸种盘、可开合的卸种口，进种口位于充种室，卸种口位于充种室的下端，吸种盘位于充种室一侧；卸种机构包括余种收集盒；落种口与进种口连通；余种收集盒接住卸种口掉落的种子。本发明通过主动换种、连续供种、自动清种的方式，在满足水稻小区育种播种作业阶段防止混种农艺要求的同时，免去了繁琐的人工换种、供种过程，提高水稻小区育种播种作业效率和精确性，属于农业机械领域。