本发明涉及矿物加工技术领域，具体而言，提供了一种含碳质物铜钼矿分离浮选方法，包括以下步骤：(1)将含碳质物铜钼矿原矿磨至一定细度后制得满足浮选浓度要求的矿浆；(2)在矿浆中依次加入铜钼捕收剂和起泡剂，而后进行粗选、扫选、精选、脱水脱药、浓缩后添加铜抑制剂和碳质物抑制剂，再经过铜钼分离粗选、扫选、精选、中矿顺序返回的铜钼分离工艺流程得到铜精矿和钼精矿后得到铜精矿和钼精矿；其可减少碳质物在钼精矿的富集，提高钼精矿的品位，实现实现钼资源高效综合回收。