本发明公开了一种多通道的信号采集方法及系统，属于电气测量技术领域。本发明方法，包括：对采集卡FPGA配置目标采集策略；根据不同的信号源，使用目标采集策略，对所述采集卡的多采集通道进行切换，以使用采集卡利用不同的采集通道接收不同信号源发出的信号；将接收的不同信号源发出的信号，经所述采集卡的多路模拟开关输入采集卡的输入缓冲单元进行缓冲；在采集卡中对缓冲的不同信号源发出的信号，进行预处理，以输出数字信号，对所述数字信号进行采集及缓存。本发明通过配置不同的采集策略，控制多通道的采集信号，提升了信号采集的效率。