本发明公开了一种基于空间交互补样的海洋环境动力要素区域频率分析方法，属于海岸、海洋工程技术领域。包括以下步骤：获取多站点海洋环境动力要素的n年时序历史数据，采用年极值法提取每个站点的海洋环境动力要素的年极值样本；计算每个站点的样本线性矩和线性矩比例系数；依据样本线性矩比例系数对所有站点进行一致性检验；对剩余满足一致性检验的站点进行聚类以划分同质性区域；为每个同质区域选择合适的概率分布模型；应用指数波方法计算每个站点的特定重现期的推算值；基于模拟结果计算各站点特定重现期推算值的置信区间；该方法可以更稳定的刻画区域内极端样本的频率分布特征，显著减少了可能因单站点数据波动导致推算结果的不稳定。