本发明公开了一种风电接入系统中HPFC装置的优化配置方法和系统，本该方法构建了以HPFC装置的装机位置和装机容量为决策变量的双层优化模型，双层优化模型包括考虑HPFC的经济性和控制效果的上层优化模型和考虑风电接入系统可用输电能力的下层优化模型，即本发明采用将HPFC装置容量与系统ATC进行分解计算的HPFC双层优化配置模型，在计算系统ATC时获取风电接入系统临界条件，计算能同时满足风电接入系统在基态和临界条件下的HPFC装机容量，解决了传统算法获得的HPFC装置的装机容量难以适应在系统临界条件的问题，扩展了所得优化配置方案的适应范围。