本申请提供了一种退火炉的对流风机控制系统及方法，其中，系统中的氮气供应模块可以向退火炉提供氮气保护气氛；氢气供应模块可以向退火炉提供氢气保护气氛；对流风机可以对退火炉中的气体进行吹扫；测量模块可以测量退火炉中的气体含量；控制模块可以在退火炉冷密封测试结束后，控制氮气供应模块向退火炉提供氮气保护气氛，并控制对流风机以预设的第一转速运行，以对退火炉进行氮气预吹扫；在对退火炉进行氮气预吹扫完成后，控制氮气供应模块关闭，控制氢气供应模块向退火炉提供氢气保护气氛，并根据测量模块测量得到的气体含量控制对流风机的转速。能够有效地避免对流风机过载损坏，提高对流风机的使用寿命。