本发明公开了电驱动系统复合健康指标构建与失效阈值判定方法及系统，其中方法步骤包括：采集用户的新能源汽车电驱动系统的载荷数据，构建多维度评价指标；基于多维度评价指标，确定用户的最小循环周期；基于最小循环周期，构建用户基础工况片段库；基于用户基础工况片段库，构建失效阈值分布模型；利用失效阈值分布模型，完成失效阈值判定。本发明提出的电驱动系统复合健康指标构造方法，用于构建表征电驱动系统退化状态指标，结合用户基础工况片段库与外推循环次数，采用蒙特卡洛仿真外推全体用户失效阈值并建立失效阈值判定准则。为电驱动系统退化状态动态评估与剩余寿命精准预测提供技术支持。