本申请公开了一种烟草花叶病防治用水肥药一体化方法，包括以下步骤：1)将辛菌胺·吗啉胍按45～55克/亩的用量，用水稀释后得到稀释液，当储液罐中的营养液还剩95～105kg时将稀释液加入储液罐中进行滴灌，每株滴95～105ml；2)将2％氨基寡糖素按用量为300毫升/亩，加水稀释，当储液罐中的营养液还剩95～105kg时，把稀释液加入储液罐进行滴灌，每株滴95～105ml；3)烟苗移栽30天后，用质量浓度为0.1％的中微量元素溶液、浓度3％超敏蛋白微粒剂15～25克/亩，加入100kg营养液中搅拌均匀后通过滴灌带进行滴灌。该方法达到促进烟株生长，提高烟株抗性，巩固前期防效的作用，进一步提高最终防效和延长药物有效期的作用。