本发明公开了一种碳捕集的有机污染物处理系统及方法，所述碳捕集的有机污染物处理系统包括碳捕集装置、光解装置和吸附装置，碳捕集装置用于利用吸收剂捕集流经碳捕集装置的烟气中的二氧化碳，光解装置与碳捕集装置相连，以使通过碳捕集装置的烟气流至光解装置，光解装置用于脱除捕集二氧化碳后的烟气中的部分有机污染物，吸附装置与光解装置相连，以使通过光解装置的烟气流至吸附装置，吸附装置用于脱除捕集二氧化碳后的烟气中的残留有机污染物。本发明的碳捕集的有机污染物处理系统，通过加设光解装置和吸附装置，对碳捕集后的烟气进行处理，能够有效分解脱除挥发性的有机胺污染物，减少污染，从而提高碳捕集工艺的环保性。