本发明属于生物医药技术领域，公开了一类深海真菌来源的吲哚生物碱与聚酮杂合体及其制备方法与在抑制细胞铁死亡和防治铁死亡相关疾病中的应用。本发明的吲哚生物碱与聚酮杂合体及其衍生物或其药学上可接受的盐由异戊烯基化的吲哚生物碱与C9聚酮组成的杂合体类新骨架化合物，是一类结构新颖的生物碱次生代谢产物，在自然界中非常罕见。本发明首次发现了异戊烯基化的吲哚生物碱与C9聚酮组成的杂合体类新骨架化合物，并证实其可通过靶向作用下调HMOX1蛋白和抑制脂质过氧化，进而抑制细胞铁死亡，可用于制备抑制细胞铁死亡的靶向药物，对铁死亡相关的疾病治疗和新药开发具有重要意义。