本发明公开了一种基于物理化学指标的水环境质量评价方法，涉及地表水水质安全评价技术领域，方法包括确定要评价的水体类型；基于水体类型和实际污染情况确定水环境质量评价所选指标，所选指标包括必选指标和参考指标；对所选指标进行数据搜集和专项调研，使得所选指标数据满足评价所需；对综合污染状况指标、综合营养状态指标、有机污染物风险状态和重金属风险状态指标进行指标计算，并基于计算结果进行等级划分；基于划分结果对水环境质量进行评价。本发明通过以多水质物理化学污染物综合指标为核心，实现了高准确度、快速的水质评价，解决了现有单因子水质评价技术中指标少、过严和综合评价法计算过程涉及参数和指标多且较难实现的弊端。