本发明涉及洪涝灾害管理技术领域，具体涉及一种基于数字孪生的洪涝灾害应急仿真方法及系统，包括以下步骤：S1，数据采集与预处理：实时采集洪涝灾害相关的环境数据；S2，建立数字孪生模型：建立洪涝灾害区域的数字孪生模型；S3，仿真计算：对洪水的传播路径、水深以及流速进行预测；S4，洪水传播路径优化：识别模式和异常；S5，应急预案制定与实时监控：结合历史洪涝灾害应对经验，制定应急预案；S6，评估与改进：在洪涝灾害应急响应结束后，对应急预案的执行效果进行评估，总结经验教训，优化数字孪生模型和应急预案。本发明，实现了对洪涝灾害的精准预测和高效应对。