本发明涉及电力系统继电保护技术领域，尤其涉及一种提高双端弱系统电流差动保护灵敏度的换流器控制方法及系统，包括：进行交流送出线路单相接地或者两相相间故障识别；当交流送出线路发生永久性故障时，新能源并网换流器执行控制策略切换，将新能源电源并网换流器切换为注入负序电流控制策略；判断是否满足电流差动保护动作判据，来确定故障是否发生在保护区域内部，并对确定的区内故障执行差动保护动作，使得交流送出线路发生短路故障时能够形成故障回路，进而使得故障点故障电流能够流通，提高电流差动保护差动电流、降低制动电流，保证区内故障时电流差动保护可靠动作，显著提升新能源电源送出双端弱系统下交流送出线路故障识别能力。