一种机气耦合式玉米脱粒装置，包括机架以及设置在机架上的柔性离散机构和机气耦合脱粒机构；柔性离散机构包括离散箱，离散箱的一端设有喂料斗，离散箱内沿其长度方向设有输送机构，在输送机构两侧对称设有两排离散滚筒，两排离散滚筒之间形成离散通道，每排离散滚筒包括可沿自身轴线旋转的水平离散滚筒和竖直离散滚筒，且输送机构两侧的水平离散滚筒和竖直离散滚筒分别对应，离散箱底部设置离散滚筒驱动部件，离散滚筒驱动部件带动至少一排离散滚筒沿自身轴线主动旋转。本机气耦合式玉米脱粒装置可通过机械和气流共同作用对玉米进行脱粒，极大的降低高含水率玉米在脱粒过程中的籽粒破损，有利于长期储存。