本申请公开了一种PCR装置及其使用方法，该PCR装置包括连续相注射器、分散相注射器、毛细管、加热组件以及离心管，连续相注射器与分散相注射器的输出端分别连接于毛细管，并在毛细管内生成液滴，加热组件包括导热模块和加热台，导热模块承靠于加热台，加热台用于对导热模块的至少一侧加热，以使导热模块的不同侧具有温度差，毛细管绕设于导热模块的外周并经过至少两个具有温度差的侧面，毛细管的远离连续相注射器与分散相注射器的一端延伸至离心管。从而，能够简化制造工艺，降低生产成本，同时降低污染风险。