一种市政智能管网排水系统及其运行方法，包括水井主体，水井主体顶部端口可拆卸的安装有导流板，导流板的底部固接有螺旋杆，导流板上以螺旋杆为中心环形阵列的设置有多个导流槽，导流槽呈倾斜状；水井主体内在位于导流板的下侧安装有分流外壳，分流外壳的底部中心设置有限位环，分流外壳通过限位环与螺旋杆配合旋接，分流外壳上设置有导流孔，分流外壳的内部设置有多个导流条；导流板上以螺旋杆为中心还环形阵列的设置有多个扩展水槽，在遇到暴雨或者特大暴雨时，能够提高雨水井的排水吞吐量，减少城市内涝情况的发生。