本发明公开了一种基于数字孪生的多塔连体结构施工形变预测控制方法，包括：建立针对塔楼以及多塔连体结构的有限元分析模型，推演其全建设周期状态下的受力以及形变状态并对施工策略进行调整；基于各塔楼在建设周期内测量的建筑参数构建数字孪生模型；建立ARMA模型并采用逆函数预报法预测塔楼的沉降数据值；基于预测结果对施工策略进行实时调整；分析各个塔楼上的连体结构预置安装点位置，并根据分析结果采取预设的调控措施进行施工控制，最终完成连体结构的安装工作。通过本发明能够实现对多塔连体结构施工的建设周期的建模分析，辅助工程师对建设周期内的施工方式进行实时调控，以使连体结构能够按照预期准确地架设在多个塔楼之间。