本申请涉及色母粒制备技术领域，尤其涉及一种环保抗菌色母粒及其制备方法。一种环保抗菌色母粒，按质量份数计，制备原料包括：线性低密度聚乙烯30‑35份、可降解改性聚乙烯树脂25‑28份、改性颜料28‑32份、抗氧剂0.1‑0.3份、聚乙烯蜡3‑4份、复合抗菌剂0.5‑0.8份、偶联剂1‑2份，其中，所述复合抗菌剂由改性银铈锌掺杂二氧化硅和环糊精改性天然抗菌剂组成。本申请的环保抗菌色母粒具有优异的抗菌性能、可降解性和力学性能，并且性能长久稳定，在聚乙烯色母粒技术领域具备重要应用价值。