本发明涉及微生物技术领域，公开了一种红酵母制备类胡萝卜素的方法和应用，所述方法包括：将红酵母培养于发酵培养基中，在蓝光下培养4天；所述发酵培养基中包括葡萄糖、酵母粉、蛋白胨、麦芽提取物、磷酸二氢钾、硫酸镁、核黄素、维生素B，其中，在发酵培养基中葡萄糖的质量浓度为20g/L，酵母粉的质量浓度为5g/L，蛋白胨的质量浓度为5g/L，麦芽提取物的质量浓度为3g/L，磷酸二氢钾的质量浓度为3g/L，硫酸镁的质量浓度为3g/L，核黄素的质量浓度为3.6mg/L，核黄素和维生素B的质量浓度比为9‑5:1‑5。本发明采用了液态培养的方法，提升了红酵母生产类胡萝卜素的产量。