本发明属于烟草种植技术领域，提供了一种烟稻轮作区绿肥紫云英与烤烟套种方法，包括：绿肥套种技术，用于改善烟田土壤结构；烤烟种植技术，用于烤烟栽培种植；通过烟稻轮作区绿肥紫云英与烤烟套种，烟田土壤结构得到改善，肥力得到保障，促进烟稻轮作烟田土壤系统的长期稳定，并减少了化肥使用量，降低了对环境的污染，且能够有效提升烟叶的产量和质量，促进了烟农增产增收；同时通过绿肥紫云英与烤烟套种，增加土壤有机物质产生，改善了土壤结构，提升了土壤肥力，避免烟稻轮作长期使用化肥，而导致土壤质量下降的问题，为烟稻长期轮作提供有力保障，从而促进粮、烟产业的稳定长久发展。