本发明公开了一种自动化的微生物菌剂用生产装置及使用方法，涉及微生物菌剂生产技术领域，包括发酵箱，所述发酵箱的外壁设置有转移组件，转移组件用于转移发酵箱内异常菌剂，伸缩杆一的底端设置有菌剂状态检测传感器，转移组件包括转移箱和控制器二，转移箱的内壁安装有温湿度检测单元二、温度调节单元二和湿度调节单元二。本发明通过设置有菌剂状态检测传感器和工业相机，在微生物菌剂的发酵过程中进行实时监测，当发酵状态出现异常时，转移组件将发酵异常的微生物菌剂移出发酵箱，避免对其他正常发酵的微生物菌剂造成污染，且在取出过程中维持发酵箱内发酵生产环境的稳定状态，避免出现温湿度的变化而造成微生物菌剂发酵生产失败的现象。