本发明提供一种流体自动分配的氢气冷却装置，包括内部设有流道的换热芯体，所述氢气冷却装置具有流体入口，所述流体入口与换热芯体之间设有流体自动分配结构，所述流体自动分配结构包括沿垂直于流体流动方向设置的固定分流板和活动分流板，所述固定分流板均匀设有若干个第一分流孔，所述活动分流板均匀设有若干个第二分流孔，所述活动分流板可相对于固定分流板运动，以控制第一分流孔和第二分流孔的连通或关闭，所述第一分流孔和第二分流孔与换热芯体内的流道的流通方向相同。本发明通过在氢气冷却器流体入口处增加流体自动分配结构使得换热介质均匀进入换热芯体，减少设备整体的热应力。