本发明提供一种典型农业系统多尺度土壤侵蚀热点识别的环境同位素方法，利用环境放射性核素示踪技术和单体化合物稳定性同位素泥沙指纹技术定量评价坡面空间土壤再分布和定量解析流域泥沙来源与负荷，识别典型农业系统多尺度侵蚀热点区；基于放射性核素示踪原理，确定坡面短、中、长期土壤侵蚀再分布速率，明确典型农业系统坡面土壤侵蚀热点区；同时利用上述联合示踪技术定量流域不同土地利用类型泥沙来源与负荷，辨识流域侵蚀泥沙来源热点。本发明可以精准识别不同农业系统多尺度侵蚀热点区域，定量评估坡面土壤侵蚀再分布速率以及定量解析流域侵蚀泥沙来源负荷，从坡面到流域尺度实现多尺度的土壤侵蚀热点识别。