本公开提出了关系型数据库的比对方法及其装置，涉及数据处理、计算机技术领域，包括：获取待比对的两个数据库标识，并基于数据库标识，从候选的关系型数据库中，确定待比对的基线数据库及匹配数据库；获取比对配置信息，基于比对配置信息从预设比对模式集合中，确定目标比对模式；基于目标比对模式，从基线数据库获取至少一个第一表对象，生成第一表对象集合，从匹配数据库中获取至少一个第二表对象，生成第二表对象集合；对第一表对象集合及第二表对象集合进行比对，获取匹配数据库相较基线数据库冗余或缺少的表对象和/或表定义内容。本公开可以多维、细致、直观的进行MySQL数据库结构比对，在数据库存在大量对象时，提高比对效率。