本发明提供了一种配电网电能质量治理分区方法及装置，属于配电网治理技术领域，该方法包括：根据网络拓扑与参数，计算配电网中各节点有功和无功电压灵敏度，求得各节点之间的电气距离；获取各节点谐波、三相不平衡以及电压偏差的历史量测数据；采用灰色关联度分析，获取变化趋势关联度和幅值关联度；对变化趋势关联度、幅值关联度以及电气距离，赋予不同权重并相加，获取综合关联度；采用谱聚类算法和手肘法，进行区域划分；选取主导节点，并在主导节点安装治理设备，完成配电网电能质量治理分区。本发明从多维度电能质量构建分区评价体系，反应节点实际关联程度，并结合灰色关联度法实现快速、准确的配电网电能质量区域划分。