本发明涉及一种用于档案库房的无人机自动盘点方法及系统，包括如下步骤：档案库房中部署好的无人机接收到盘点指令，所述盘点指令包含盘点区域的位置信息，无人机根据盘点指令搜索存储在无人机内部的位置坐标，根据位置坐标获取飞行路线，飞到需要盘点的密集架旁；无人机发送指令打开密集架并根据盘点区域规划盘点轨迹后，飞入密集架中，打开无人机上的识别模块，按照盘点轨迹对需要盘点区域内的档案进行扫描识别，并将盘点数据记录在无人机中；完成盘点任务后，无人机发送指令关闭密集架并飞回起飞区，将盘点数据通过起飞区的数据接口传入档案管理系统并进行更新。本发明的优点：提高盘点工作的自动化水平和准确率，保证盘点区域无死角。