本发明公开了一种用于谐振接地系统的高阻故障检测方法及系统，方法包括：将各个馈线零序电流暂态分量划分为第一分段、第二分段以及第三分段，选取出第一分段中能量占比最大的目标馈线零序电流暂态分量，并计算与目标馈线零序电流暂态分量相对应的三个分段的能量占比；在第一分段内根据暂态分量投影系数极性差异表征暂态初始极性并构建第一判据，在第二分段内根据暂态平均能量构建第二判据，在第三分段内根据相似度指标构建第三判据；分别对第一分段、第二分段以及第三分段设置能力占比阈值，针对不同工况执行相应的第一判据、第二判据以及第三判据，并输出最终故障检测结果。充分利用不同维度故障暂态特征信息，提升检测结果的可靠性和准确性。