本申请公开了一种网络拓扑的确定方法、装置、设备、系统及存储介质，涉及通信技术领域。以控制器执行该方法为例，向多个节点分别发送第一探测指令，第一探测指令用于多个节点返回第一拓扑参考信息，任一第一拓扑参考信息包括第一节点与至少一个第二节点之间传输报文的往返时间，第一节点为多个节点中接收到第一探测指令的任一节点，第二节点为多个节点中除第一节点之外的节点；接收多个节点分别发送的第一拓扑参考信息；基于多个节点分别发送的第一拓扑参考信息确定多个网络拓扑，多个网络拓扑包括以多个节点中的每个节点作为根节点的网络拓扑。该方法无需借助第三方工具，提高了该方法的普遍适用性，且无需读取设备内部信息，不存在安全问题。