本公开涉及智能变电站二次系统测试技术领域，提供一种智能变电站二次系统的贯通式测试方法及装置，该方法包括：将采集模拟器采集的试验数据注入合并单元，以驱动二次系统工作；通过开关模拟器接收所述二次系统中智能操作箱的开关状态信息，其中，所述开关状态信息包括开关变位信息和开关位置信息；根据所述开关状态信息对所述二次系统进行保护整组联动测试，其中，所述保护整组联动测试的保护类型包括单间隔保护、层次化保护和多源信息保护。本公开能够在保持二次系统联接的完整性和输入信息完整性的基础上，结合不同的保护类型对二次系统的保护整组联动进行完整、有效测试，提高变电站现场测试质量和效率，有利于电网安全和电网稳定运行。