本发明提供了充电机自动识别锂电池通讯协议的控制方法及其控制装置，包括：充电机发出不同握手帧，侦测锂电池BMS通讯协议；获取到锂电池BMS的通讯协议并进行锁定，对CAN通讯重新配置与锂电池BMS建立通讯；充电机将已锁定通讯协议编号及波特率存储于EEPROM芯片中；下次充电机重新上电时，读取EEPROM芯片存储的通讯协议编号及波特率，对CAN通讯重新配置并与锂电池BMS建立正常通讯，不再主动侦测锂电池BMS通讯协议；若充电机更换对其它不同通讯协议的锂电池充电，会重新主动去侦测锂电池BMS的通讯协议，也会将新的通讯协议编号及其波特率存储在EEPROM芯片中。本发明使得充电机能够适应不同通讯协议的锂电池BMS，并且整个过程都是自动实现的，无需人工去干预。