本发明涉及一种编码半胱氨酸蛋白酶的新基因，该基因在水稻花粉囊中特异性表达，本发明还涉及该基因的花粉囊特异性启动子，以及一种通过抑制所述基因的表达来制备雄性不育水稻的方法。本发明的rCysPl基因是一种编码半胱氨酸蛋白酶的新基因，该基因在水稻花粉囊中特异性表达，因此与花粉发育相关。因此，抑制该基因的表达可能用于制备雄性不育水稻，由于这种抑制在水稻中导致花粉退化，因此该种水稻能够控制种子的生成。此外，本发明的上述基因还可用于其它禾本科植物，并利用过度表达表现出的对抗特性而显示出优势。