本发明涉及新的亚砜和双亚砜化合物、含亚砜或双亚砜化合物的组合物和用于治疗和预防心血管疾病、异常脂血症、异常脂蛋白血症和葡萄糖代谢紊乱的方法，该方法包括给予含醚化合物的组合物。本发明的化合物和组合物也可用于治疗和预防阿尔滋海默氏病、X综合征、与过氧化物酶体增殖物激活性受体有关的疾病、败血症、血栓形成疾病、肥胖症、胰腺炎、高血压、肾病、癌症、炎症和阳痿。在某些实施方案中，本发明的化合物和组合物可用于与其它的治疗药物例如降胆固醇和降血糖药物的联合疗法。