本实用新型公开一种高压均质机工作循环系统，包括有溶菌罐，溶菌罐的出液口连接有第一抽液泵，溶菌罐内设有均质搅拌装置，第一抽液泵通过连接管道依次连接有高位贮罐、高压均质机、热交换器、接收罐，高位贮罐和接收罐的入液口分别设有第一过滤器和第二过滤器，接收罐的出液口通过循环管道连通高位贮罐的入液口，循环管道上设有第二抽液泵，热交换器连接有冷水系统。与现有技术相比，本实用新型可以有效地减少细胞提取液中热敏物质的损坏，尽量保证细胞提取液的完整；其次，避免了高压均质机的泵口堵塞，保证了高压均质机的破碎效果，减少了高压均质机的损坏次数，减少了高压均质机的维修成本。