本实用新型公开了一种新能源汽车电机控制器电磁兼容测试系统,包括电机控制器、电脑、低压供电电源、高压供电电源，所述低压供电电源、高压供电电源分别与所述电机控制器的低压输入端和高压输入端相连，所述电脑与所述电机控制器的CAN接口相连，所述系统还包括三相电阻负载箱，所述三相电阻负载箱作为所述电机控制器的负载，与所述电机控制器的高压三相输出端连接。使用三相电阻负载箱模拟电机控制器的负载，实现电机控制器带载运行，而且用三相电阻负载箱代替传统的电机负载，由于电阻负载箱为无源设备，不对外产生电磁辐射，所以该测试系统对暗室内部的背景噪声无影响，满足暗室电磁兼容背景辐射指标要求。