本实用新型涉及肽活性检测技术领域，且公开了一种食源性小分子肽活性检测装置，包括混合检测箱和检测台，检测台底部的四角处均固定连接有支撑腿，检测台的下表面通过安装架固定连接有驱动电机，驱动电机的输出端固定连接有转轴，转轴的另一端贯穿检测台并与混合检测箱底部的中心处固定连接，混合检测箱为顶部开口结构，且开口位置处合页连接有匹配的箱盖，箱盖与混合检测箱之间安装有搭扣，混合检测箱内对称设置有搅拌杆，搅拌杆的底端固定连接有转杆，转杆的另一端贯穿混合检测箱底部并向下延伸。本实用新型使得食源性小分子肽活性检测装置具备良好的搅拌混合效果，从而有效保证检测精度。