本实用新型涉及一种用于马铃薯捡拾机的自动换箱系统及马铃薯捡拾机，包括马铃薯捡拾机的机架，其特征在于，还包括机械臂、两个上输送带和两个下输送带，所述机械臂有两个且通过丝杠设置在所述机架一端，所述两个上输送带对称设置在所述机架的上部两侧，所述两个下输送带对称设置在所述机架的下部两侧，且所述下输送带位于同侧上输送带的输出端下方，所述下输送带经过所述马铃薯捡拾机的泄薯口下方；所述机械臂、上输送带、下输送带的控制器分别与所述马铃薯捡拾机的控制系统连接；所述机架上还设置有空箱存放处。本实用新型保证了马铃薯捡拾过程的平稳运行，提高了马铃薯的收集率，使设备利用率提高，同时减少了人员的投入，降低了生产成本。