本实用新型公开了一种便携式单颗粒采样器，包括采集筒以及设置在所述采集筒外部的防护壳体，所述采集筒采集口一端设置有密封组件，所述采集筒远离采集口一端设置有负压组件，所述负压组件包括沿所述采集筒长度方向滑动设置的密封活塞，所述密封活塞上固定安装有截面呈凵形的驱动架，所述驱动架上螺纹安装有调节丝杆，所述调节丝杆端部穿过所述采集筒底面并通过连接轴承与所述采集筒底面活动连接，所述调节丝杆端部传动连接有驱动马达，且所述驱动马达固定安装在所述防护壳体内壁上，本实用新型结构设计合理，能够快速便捷地实现对单颗粒的采样操作，具有结构简单、操作便捷、便于携带的特点。