本实用新型涉及一种质谱检测系统及离子源装置，离子源装置包括壳体、聚焦孔板、喷雾毛细管、气路组件及进样组件。壳体设有电离腔，壳体还设有与电离腔相通的进样口、出样口及进气口。出样口与进气口分别位于壳体的相对两端。聚焦孔板与壳体相连，聚焦孔板设有通孔。通孔与出样口相连通，通孔还用于与质谱仪的质谱入口连通。喷雾毛细管贯穿壳体伸入到电离腔的内部，喷雾毛细管的喷雾端对着通孔且形成的喷雾区域覆盖通孔。气路组件设有第一吹气端，第一吹气端与进气口相连通，第一吹气端的辅助气通过进气口进入到电离腔。进样组件的输出端与进样口相连通，进样组件的输入端用于通入待测样品。如此，离子源装置能够提高电离效率，保证检测效果。