本实用新型涉及一种提高木糖醇离交效率的离交系统，包括脱色液罐、离子交换液罐以及连接管路，在脱色液罐中暂存有木糖醇脱色液，在离子交换液罐中暂存有木糖醇离子交换液，在连接管路上分别串联设置离心泵和在线pH仪，在离心泵与在线pH仪之间的连接管路上并联设置有至少三个离子交换管路，在每一个的离子交换管路上分别串联设置有气动蝶阀和离子交换柱组合。本实用新型还公开使用该离交系统来提高木糖醇离交效率的方法。本实用新型提高离子交换柱的利用率及降低离子交换柱更换的频率。