本实用新型提供一种用于生态厕所的收集系统，涉及环保设备领域，包括左收集箱、中间收集箱和右收集箱，左收集箱、中间收集箱和右收集箱的内腔中部均设置有粪污收集槽，左收集箱远离中间收集箱的一侧连通有溢流水箱，溢流水箱的底部一侧设置有排液泵，溢流水箱的内底部且位于溢流水箱与左收集箱连通处设置有提渣栏，提渣栏与连通水管相对设置。该用于生态厕所的收集系统，在收集阶段让排放物达到固液分离状态，让液体及固体分别进行微生物处理，提高降解效率，降解完的液体达到环境许可的排放标准，固体可直接堆肥，收集系统进行了模块化设计，具备更好的移动性和普遍适用性，该收集系统结构灵活，可根据实际设计需求增加收集箱。